USAF đang tập trung vào việc làm cho chiếc máy bay thử nghiệm mang tính đại diện cao nhất có thể. Họ giải thích rằng chiếc B-21 thử nghiệm và các hệ thống nhiệm vụ của nó được chế tạo trên cùng một dây chuyền sản xuất, cùng loại thiết bị và sử dụng cùng đội ngũ nhân lực mà sẽ được sử dụng trong quá trình sản xuất cuối cùng, nhằm đẩy nhanh quá trình chế tạo.
Chiếc B-21 đầu tiên bay thử nghiệm tại Căn cứ Không quân Edwards.
Khi B-21 đi vào hoạt động, Căn cứ Không quân Ellsworth, bang Nam Dakota, sẽ là căn cứ điều hành chính của chiếc B-21 đầu tiên và là nơi đơn vị huấn luyện chính thức đóng quân. Còn các địa điểm ưu tiên còn lại là Căn cứ Whiteman (Missouri) và Căn cứ Dyess (Texas), những nơi này sẽ nhận oanh tạc cơ khi chúng đã sẵn sàng.
Trước đó vào ngày 22/1/2024, Bộ Quốc phòng Mỹ tuyên bố bắt đầu sản xuất quy mô thấp B-21 Raider và quá trình chế tạo diễn ra tại nhà máy Plant 42 của USAF ở nam California, với chiếc B-21 đầu tiên đã chế tạo xong từ đầu năm 2021 (mã số AF 0001). B-21 đánh dấu đỉnh cao của chương trình Oanh tạc cơ Tấn công Tầm xa (LRS-B), được bắt đầu vào năm 2011 nhằm tạo ra máy bay ném bom thế hệ tiếp theo cho Không quân Mỹ.
B-21 trong kho chứa máy bay tại Plant 42.
Một phân tích do GlobalData thực hiện cho biết chi phí mỗi đơn vị ước tính vào khoảng 750 triệu USD (đã điều chỉnh lạm phát), giảm đáng kể so với mức 2 tỷ USD/chiếc trong số 20 oanh tạc cơ B-2 cũ hơn – loại mà nó sẽ thay thế. Chi phí trên mỗi máy bay giảm được cho là do sản xuất trên quy mô lớn và những cải tiến trong lớp phủ tàng hình giúp giảm nhu cầu bảo trì, dù số liệu chính xác được quân đội Mỹ giữ bí mật.